Los objetivos del Sistema nacional de Áreas Protegidas (SNAP), son los siguientes:
- Conservación efectiva y permanente de la biodiversidad y del patrimonio natural, paisajístico y cultural asociado, incluyendo elementos clave para la identidad regional y local.
- Representatividad ecológica, asegurando la inclusión de todos los tipos de ecosistemas y su diversidad genética.
- Mantención y recuperación de servicios ecosistémicos, esenciales para el bienestar humano.
- Integración en instrumentos de planificación territorial y desarrollo, asegurando coherencia con políticas nacionales, regionales y locales.
- Reconocimiento y fomento de actividades educativas, científicas, recreacionales y culturales, de manera coherente con los objetivos de conservación.
- Conectividad ecológica, mediante corredores biológicos y zonas de amortiguación.
- Participación activa de personas, comunidades locales y pueblos indígenas, especialmente aquellas vinculadas territorial o culturalmente a las áreas.
- Valoración y resguardo de saberes indígenas y locales en relación con la biodiversidad.
- Monitoreo y generación de conocimiento sobre cambio climático, con énfasis en medidas de adaptación y mitigación desde las áreas protegidas.
